总体上，沪港通与QFII（合格境外机构投资者）、QDII（合格境内机构投资者）制度具有一定的共同之处，都是在我国资本账户尚未完全开放的背景下，为进一步丰富跨境投资方式，加强资本市场对外开放程度而做出的特殊安排。
沪港通
在具体制度安排上，沪港通与QFII、QDII又存在以下主要区别。
1.业务载体不同
沪港通是以两地交易所为载体，互相建立起市场连接，并对订单进行路由，从而帮助投资者实现跨市场投资。而QFII和QDII则是以资产管理公司为载体，通过向投资者发行金融产品吸收资金来进行投资。
2.投资方向不同
沪港通包含两个投资方向，分别是香港投资者投资上交所市场的沪股通，和内地投资者投资香港市场的港股通。QFII和QDII则是单向的投资方式。
3.交易货币不同
沪港通投资者仅以人民帀作为交易货帀，无论是内地投资者还是香港投资者均需以人民帀进行投资。QFII和QDII的投资者则以美元等外帀进行投资。
4.跨境资金管理方式不同
沪港通对资金实施闭合路径管理，卖出股票获得的资金必须沿原路径返回，不能留存在当地市场。QFII和QDII买卖证券的资金则可以留存在当地市场。
这样看，沪港通与QFII、QDII存在一定差异，且不会对后者等现行制度的正常运行造成影响，反而可以更好地实现优势互补，为投资者跨境投资提供更加灵活的选择，在促进我国资本市场双向开放方面发挥积极的作用。
