乔布斯离开后，卖掉了苹果电脑公司几乎所有的股票，只象征性地保留一股。他创立了Next公司。这一次乔布斯吸取了上一次的教训，持有Next公司63%的股份，他要有控股权。随后，苹果电脑公司起诉-乔布斯带走公司机密，挖走技术人员。但次年1月，苹果电脑公司又撇回了起诉，乔布斯同意六个月内不雇用苹果电脑公司职员，并且不建立与苹果电脑竞争的电脑公司。
Next公司后来更名为NeXT公司。1987年，NeXT 公司获得了富翁罗斯.佩罗(Ross Perot)的投资。1989 年,佳能公司向NeXT公司投资1亿美元。1993年，NeXT 公司更名为NeXT软件公司，彻底放弃了硬件业务。离开苹果电脑公司后，创办与经营NeXT是一段屡败屡战的艰难历程，但也正是这段历程让乔布斯真正成熟起来。
在离开苹果电脑公司的那段时间里,除了创办和经营NeXT外,乔布斯还于1986 年斥资1 000万美元购买了视角效果工作室皮克斯(Pixar)公司。皮克斯出品了一些最受欢迎的动画电影，包括《玩具总动员》《玩具总动员2》《怪物公司》《海底总动员》等。1995年,皮克斯公司在纳斯达克上市，乔布斯身家超过10亿美元。2006年，迪士尼用大约74亿美元的价格收购皮克斯，收购后二者合并，乔布斯在迪士尼董事会获得一席之地,并成为迪士尼最大个人股东。
1996年12月20日，苹果电脑公司宣布以4. 27亿美元收购NeXT软件公司，其中包括3. 775亿美元现金、2 500万美元的苹果股票以及1 600万美元的苹果股票认购权。作为NeXT软件公司最大股东，乔布斯从这项交易中获得了1亿美元现金和150万股苹果股票。
乔布斯终于回归苹果，出任苹果电脑公司董事会主席吉尔●阿米里奥(Gil Amelio)的顾问。但乔布斯似乎对当时的苹果信心不足，随着苹果股价的持续走低，1997 年6月,他毅然卖掉了150万股苹果股票,又一次象征性地留下一股。
苹果仍在财政上努力挣扎。1997年6月苹果电脑公司宜布第二季度亏损7.4亿美元。1997年7月9日，苹果股价仅3.19美元，跌到12年中的最低点。
1997年8月，苹果电脑公司宣布乔布斯为董事会成员。接着,乔布斯用自己的朋友替换苹果电脑公司的董事，重组了董事会。这一消息一公布，苹果股价开始上扬，暂时摆脱了濒临破产的尴尬境地。
新官上任三把火。乔布斯对苹果进行了大刀阔斧的改革。首先，他重估了苹果股票期权的价值,把员工的业绩与股票奖金挂钩，于是员工的土气被激发出来了。其次，引入了微软,微软向苹果注资1.5亿美元，获得了苹果电脑公司非投票权股票，微软同意为Mac 机研发办公软件。作为交换，苹果电脑公司撤销了对微软侵犯版权的诉讼，并将微软IE浏览器集成到苹果操作系统中，这夯实了苹果的现金基础(微软在后来售出了所持有的全部苹果电脑公司股票)。再次，乔布斯辞掉了与他意见不合的主管,换上了他信任的人。最后,还出台了一些大大小小的新规定。
1998年8月，苹果电脑公司发布iMac 电脑并大获成功，这让苹果在当年重新恢复了盈利。1998 年10月，苹果电脑公司宣布自1995年以来的第一个盈利年份。
2000年1月，乔布斯对外宣布去掉了自己头衔中的“临时”字样,成为苹果电脑公司正式CE0。这一年，乔布斯被授予1000万股苹果股票，按当时的股价价值8. 7亿美元。
伴随互联网泡沫,公司股价在2000年一度摸高到150. 4美元。
2001年10月，iPod数码音乐播放器发布开大获成功。但互联网泡沫破裂后，2001年，苹果电脑公司宣布该年第一季度损失2.59亿美元。这是苹果电脑公司三年来首次遭遇季度财务亏损。但200年4月，苹果电脑公司宣布二季度利润为4300万美元。截至9月98的财年底，苹果电脑公司税前亏损5200万美元，税后亏损3 700万美元。2002年第一财年季度,苹果电脑公司宣布盈利3800万美元，第四季度，苹果电脑公司又宣布亏损4500万美元。2002年，苹果电脑公司获得了57. 42亿美元的收入，毛利润16亿美元，净利润6500万美元。
2003财年，苹果电脑公司实现收入62亿美元，净利润5700万美元。自此开始，苹果股价开始史无前例地增长。2004 财年，依然是苹果电脑公司巨大增长的一年，该年度净利润为2.66亿美元。2004年7月，乔布斯被查出胰腺癌，消息一出,苹果股价重挫。
2005财年，苹果电脑公司实现收入139亿美元，净利润13亿美元，首次打破10亿美元的利润大关。净利润399%的增长令人咋舌。
2006年1月，苹果电脑公司市值首次超过了戴尔公司。2006 财年，实现收入193亿美元，增长39%;净利润突破20亿美元大关，增长接近50%。
2007年1月9日,苹果电脑公司更名为苹果公司，摆脱了给人以只做电脑的印象。
2007年，苹果公司推出了iPhone、 iPod touch。这为该公司赚取了平均一天100万美元的商业利润。不到3个月，苹果公司便成为了世界上第三大移动电话的出厂公司。据经济之声《天下财经》报道，苹果公司每卖出一台iPhone,就独占58. 5%的利润。2007 财年，苹果公司实现的收人为240亿美元，增长24%;净利润35亿美元，增长76%。
2010年1月27日,苹果公司推出了iPad。4月3日，苹果公司推出iPad系列产品。2011年3月2日，苹果公司推出iPad2系列产品。
2011年10月5日，苹果公司椎出iPhone4s, ios5, icloud。 同时发布iPhone4 8G版。第二天，即2011 年10月6日,史蒂夫.乔布斯去世，享年56岁。天才陨落了。
2011年10月26日,苹果公司公布了2011财年(截止于2011年9月24日)业绩，苹果公司实现净收入(Net sales) 1082亿美元，净利润(Net income)为259亿美元。而2011财年的净收入仅为652亿美元，净利润为140亿美元，增长近一倍。
2012年1月25日,苹果公司公布了2012财年第一季度(即截至2011年12月31日止的前三个月，Q1 FY12)业绩，苹果公司实现净收人463亿美元，净利润130.64亿美元。
