期货基础交易。该策略寻求在期货合同和相同期限的金融产品间价差，从而进行套利。国债期货持有人会在期货到期时收到国债。通常来说，国债期货需要交付国债的一方可以选择交付之前决定的一揽子债务证券，以此避免短期挤压并保持市场流动性。国债期货到期时，“最便宜交割”的证券将被交付。因此国债期货到期时，“最便宜交割”债券和期货合同的价格会交会。“最便宜交割”债券具有不确定性，这为套利者提供了贏利机会。基于单个证券的期货合同基础是其标的现货价格和期货价格的不同。两者的差价为套利者提供了机会。期货合同中的交割期权表现在“最便宜交割”债券变化的可能性及在交割月中何时结算债券的时间。期货合同中持有空头的交易部分同时也是看涨交割期权。期货定价中最难的就是评估交割期权的价值。对冲基金经理创造了各种逐步成熟的数学模型为期货定价。由于资金流向不同市场，期货市场会定期与与其平行的债券和债券期权市场发生偏离。这些传统投资者的资金流动为对冲基金经理创造了套利机会。
互换价差交易。基金经理利用市场上国债参与者愿意购买利率互换的固定收益和拥有相似久期的国债收益间的价差进行套利。以短期利率借入资金买国债产生了浮动利率的出口及固定利率的人口。该仓位相当于在一定时期内以浮动利率购买利率互换，得到固定收益。互换曲线由不同到期曰利率互换的固定利率组成。互换的固定利率通常不会与国债的收益率重合。价差的扩大和缩小为对冲基金经理提供了套利机会。不同货币有自己的互换曲线：美元、欧元、英镑、挪威克朗等。比如，基金经理可做如下操作：预测澳元互换曲线陡峭；预测英镑互换曲线是蝴蝶状；预测美元互换曲线长期陡峭；预测挪威克朗互换曲线短期平坦。
其他价差交易。如市政债券和国债间的利差。基金经理总是寻求金融产品观察值和理论值之间的暂时偏离而获利。
资本结构套利。投资者分割金融工具并专注于企业结构的单个板块，由此使组成资本架构不同部分相对价值的不一致暴露出来。这为可自由移动资本结构不同组成部分的交易者提供了贏利机会。Merton的模型解释了不同类型的资本结构选择股票和债券以公司价值为基础。股东拥有公司偿还债务后的剩余价值，股票可以看作是认为公司增值的期权。然而债券持有人要承担公司破产时其资产少于债务的风险，因此债券可以看作是认为公司贬值的期权。Merton的模型解释了债务可以看作是看空公司资产的看跌期权，以及股票可以看作是看涨公司资产的、执行价与公司债务账面价值相同的看涨期权。根据期权定价理论，公司资产的价值可由证券的价格分布得到。根据公司财务报表，资产价值等于债务和股票的市值。如果减去图片市值得到债务市值，则得到公司信誉的隐含价差。因此，股票和债券组成了代表公司资本架构的统一体。发行者破产的情况下，清算从高级银行贷款开始，然后是高级债券、次级债券，如果还有剩余流动资金，则是股东。资本结构套利的一个简单方法是买高级银行债券并卖空次级债券。资本结构套利策略旨在捕捉同一发行者资本架构中不同成份间的价差。对冲基金可以同时投资一间公司的所有证券（企业债券，可转换债券，普通股，优先股，担保高级、中间级或刺激债务，其中根据优先权大小把证券排列如图9.11所示），以此抓住某资本结构的可行套利机会。该策略基于两个证券的相对价值，对冲掉市场系统风险。基金经理创造的阿尔法依赖于他在资本结构证券间鉴别出更多复杂而不是简单而明显的关系，比如复杂性可以通过公司破产情况下的索赔资历、合同权利、法律问题等增加。
