复合基金在构建投资组合前必须考虑很多可变因素。很多基金经理从确定所要投资的基金的类型和不同类型的基金在投资组合中所占比例开始。复合基金可能会把自己的投资范围限定为市场中性基金、股票基金、只投资美国本土资产的基金等，这个最初的决定能够在很大程度上影响基金最终的投资特点。
投资对冲基金的历史收益也许是影响基金选取结果的最重要的因素。一般来说，如果复合基金经理人确信某只对冲基金的高收益是能够延续的，那么收益最高的基金最可能被选中。基金经理在同属于某个类型的多个基金中做选择时，也会采取这样的方法：选取最近表现糟糕但将很快转好的基金。对冲基金的费率高低也会影响到哪只基金将会入选，因为对于同一种类型的基金，费用高低直接影响投资者的净收血。
复合基金的经理还要考虑投资者承担的风险，低风险好于高风险，但是对风险的衡量却有很多种方法。主要的方法是收益波动率(或者说标准差),标准差还有很多变形形式，下偏半方差(downside devia-tion)将(渴望得到的)实际收益高于预期收益的偏差与(不希望出现的)实际收益低于预期收益的偏差区别对待。基金经理们还综合其他的风险测量(市场跌幅、损失的概率、最大的月损失、损失月份的连续时间等)因素设计出风险最小的复合基金。
复合基金的经理非常注意基金之间的相关性。通过选择相关性低的基金进行分散化投资，可以更大程度上降低基金的总风险。经理们还需要具备控制基金组合与股票指数、债券指数相关度的能力。与指数相关性低的复合基金对于潜在的投资者来说更具吸引力。
复合基金要对其组合中每一个基金进行尽职调查(due diligence review),这种尽职调查考虑所有可能导致未来损失的因素。尽职调查的内容包括对基金业绩的全面审查，审查过程要应用各种风险衡量方法。
更重要的是，尽职调查要找出可能失控的潜在危险、欺诈的征兆和那些并不按自己的承诺进行运作的基金。复合基金的经理要找出基金背后出资比例很大的主要合伙人。对于某些基金经理来说，这非常重要。复合基金的经理更喜欢将基金资产的头寸状况完全向投资者公布(即透明)的对冲基金。有了获得信息的便利，复合基金就不需对欲投资的具体基金投入过多的精力(否则，收集所有基金的信息将非常困难),复合基金经理也就能够确定投资对象基金是否按照其策略运作。实际上，大多数对冲基金拒绝详细披露头寸情况。
复合基金经理必须研究多个备选基金，个别对冲基金的封闭期限制了复合基金对其投资者的流动性。新增的投资者出资能够应对封闭期，重新平衡投资组合，这使得复合基金在封闭期的限制下仍然能够保持灵活性。
个别基金的投资上限(capacity constraints)可能会影响到复合基金的投资规模。复合基金可能会对那些将要停止接受新投资的对冲基金追加额外的投资，那么经理必须能够预见到将会出现的投资上限问题，并且在必须进行追加额外投资而又遇到投资上限之前，找到其他同类型的基金作为投资对象。
