上市公司发生的担保、诉讼等或有事项，对上市公司的经营发展也有着较大的影响，对此，注册会计师也将在审计意见中表达出来。如深圳鹏城会计师事务所对深特力2000年中期报告作出解释性说明，其原因是该公司为深圳中浩集团股份有限公司提供担保1500万元及借款利息约1050万元，因逾期未还，承担连带责任。法院已查封公司部分房产。截至2000年6月30日，尚余1588.87万元担保的潜在损失。另外，公司逾期借款约2781.06万元，应付相关借款利息3338.87万元。投资者据此可以判断公司的风险性。
根据管理部门的规定，如上市公司的财务报告被注册会计师出具非标准无保留审计意见，其涉及事项不属于明显违反会计准则、制度及相关信息披露规范规定的，上市公司董事会应当在相应的定期报告中针对该审计意见涉及的事项作出详细说明，包括非标准无保留审计意见涉及事项的基本情况；注册会计师对该事项的基本意见；公司事会、监事会和管理层等对该事项的意见；该事项对上市公司的影响程度；消除该事项及其影响的可能性；消除该事项及其影响的具体措施。
阅读上市公司的解释与说明，有利于投资者更加全面地了解上市公司的情况。投资者可以将公司的说明与注册会计师的审计意见对照阅读，并就其中提到的一些问题作进一步的分析。但是，值得注意的是，有的上市公司在对注册会计师的审计意见作解释性说明时，过于强调客观原因，或者作些不着边际的空洞解释，有的甚至强词夺理，扭曲或否定注册会计师的审计意见，对此投资者要注意分辨。
如郑百文2001年年报被出具了保留意见及带解释性说明的审计报告，郑百文在年报中以临时报告形式对上述内容给予了披露。对注册会计师对2001年“年初数”问题出具的保留意见，郑百文董事会解释，这指的是前任会计师事务所对公司2000年报出具了拒绝表示意见的审计报告，言下之意似乎与当年无关。事实上，据2000年年报审计报告指出，导致当时的注册会计师拒绝表示意见的主要因素也是1999年度会计报表及2000年度中期会计报表存在怀疑，可见所涉及的事项具有连续性的特点，由于相关年份造假账的因素导致其此后的任何以持续经营为假设前提的财务报表的真实性和有效性都可能存在问题。更何况，郑百文2001年的盈利，本身也是一个精心设计的结果。公司少计提1228.77万元坏账准备，其合理性大可置疑。我们如果注意了解一点郑百文的历史，便不难看出其中的内情绝不像郑百文解释的那样合乎情理。
另外有一家公司的年报对注册会计师审计报告中的一段不足300字的解释性说明段用了洋洋洒洒的4400余字进行反解释。该公司控股子公司主要资产的产权纠纷；是一项历史遗留问题，诚如注册会计师所述，在诉讼仍未判决，且此项判决最终结果将对子公司及该上市公司的资产总额产生影响的情况下，估价入账金额的最终调整，对子公司及该上市公司的资产及损益均将产生影响。而该公司董事会报告却以落实整改意见为由，认为该项行为不属于明显违反会计准则、制度及相关信息披露规范规定的行为。
注册会计师的审计报告是进行独立审计后作出的，被审计的上市公司对审计涉及的问题作出解释性说明是可以的，但无权按自己的理解去设释市计意见，更不能曲解审计意见，这不仅影响到审计意见的严肃性，而且对需要阅读审计报告的股东和其他投资者有误导之嫌。
根据《非标准无保留审计意见及其涉及事项的处理》的规定，如上市公司拒绝就明显违反会计准则、制度及相关信息披露规范规定的事项作出调整，或者调整后注册会计师认为其仍然明显违反会计准则、制度及相关信息披露规范规定，进而出具了非标准无保留审计意见的，上市公司要遭到停牌处理。因此，对于这些公司，在情况没有完全明朗前，投资者不要贸然介入。如果投资者已经持有了被出具非标准无保留审计意见上市公司的股票，那么他就应该注意分析五个方面的内容：一是这些涉及的事项或交易都是些什么问题；二是要看注册会计出具的审计报告的类型，也就是说“不干净”的程度；三是要看涉及的交易事项对利润的影响程度；四是要看公司管理层或者董事会对这些事件的看法；五是要判断公司能不能消除这种交易或者事项的可能性以及有关措施。如果通过分析，情况不容乐观，或者未来变数较大，那么就应该考虑换股。俗话说，“君子不立危墙之下”，如果一家公司的财务报表受到注册会计师的质疑，投资者就应该高度警惕。如果没有确切的把握，投资者要尽量回避与远离那些被出具了否定意见或者无法表示意见审计报告的公司。
当然，以上的分析，都是以注册会计师忠实履行其审计职责为前提的。如果注册会计师草率从事、敷衍塞责，甚至与造假公司同流合污、为虎作怅，则出具的审计报告不真实、不准确，这将严重误导投资者。事实上，近年来发现的多起上市公司造假制假事件，基本上都有注册会计师不光彩的身影。先是原湖北立华会计师事务所被揭出系列造假案，接着中天勤会计师事务所卷入银广夏、三九药业会计信息造假案，一时间，注册会计师的信任度大打折扣。
提供中介服务的注册会计师，在上市公司年报或中报披露中扮演着极其重要的角色。由于上市公司经营权与所有权分离，股东判断上市公司财务报表的真假，需要注册会计师作为公正的第三者，对企业编制的财务报表进行审计。注册会计师对被审计上市公司会计报表所反映的财务状况、经营情况等表明意见，是投资者评判上市公司的主要依据。但如果注册会计师严重失职，不按程序进行认真审计，甚至是为了自身利益而帮助上市公司造假制假，其出具的审计报告则是对投资者的一种欺骗，一种误导。因此，在此我们提醒广大投资者，我们要重视注册会计师的审计报告，但不能过于轻信审计报告，尤其是不能用审计报告替代财务报表的分析。当然，一般来说，如果是出具的保留、拒绝甚至否定意见的审计报告，则虚假成分很少，很简单的道理，这些不利于上市公司的审计报告，注册会计师没有掌握比较充足的依据，是不可能出具的； 几乎所有的不实与虚假审计报告，都是无保留意见的审计报告。这就提示投资者，对于无保留意见的审计报告，我们不要盲目轻信，而要根据具体的财务报表进行具体分析，避免审计报告的失误或者有意造假。
